巨大的经费从何而来？1人年薪115万元，20人就是两三千万元。虽然不是所有的教师都能享受如此高薪，但普通正副教授的年薪恐怕也要几十万元吧。假如人均年薪50万元，1000名教师的年薪就是5亿元。香港科大的高薪是以高学费作支撑的。要知道，香港科大人均年学费高达4万多元，是内地公办高校的10倍左右。在内地，根本不可能按照香港科大那样的标准收费，那么南方科大拿什么来维持教师的高薪呢？难道依靠国家的拨款吗？
更重要的是如何选才。年薪超过百万，肯定门庭若市。而学术水平往往没有公认的标准，你认为某人水平很高，换个人也可能会认为某人水平很低。虽然南方科大应该会成为一个评价机构，但这个机构能否公正地评判呢？依目前的国情，权力、金钱的干扰是难免的，南方科大抵御得了吗？比如深圳市有关领导或主管部门的负责人“推荐”了几名教授，南方科大是不是能一口回绝呢？——别忘了：深圳市政府是南方科大的“老板”，很多事情也都需要主管部门的审批……
行政化是目前内地高校存在的最大的问题之一，因为是公办性质，学校的很多方面都受到行政权力的制肘。而香港科大等世界绝大多数名牌大学都是私立的，教学、科研以及管理等所有的事务都拥有自主权，而且学术自由、机制灵活、监管到位。作为一所公办的高校，如果没有强有力的体制保障，南方科大要“向香港知名大学看齐”恐怕仍有很长的路要走。
