大陆高校欠缺有影响力的国际学术大师
值得注意的是，这一排名设置了校友和教师获得诺贝尔奖和数学菲尔兹奖数量的指标。四地有三所大学培养过诺奖得主：1957年诺贝尔物理学奖获得者杨振宁1944年毕业于清华大学(西南联大清华研究院)，1986年诺贝尔化学奖获得者李远哲曾在台湾大学取得学士学位(1959)、在清华大学(新竹)取得硕士学位(1961)。李政道和丘成桐因没有取得过国内大学学位而不计。香港中文大学是两岸四地大学中唯一一个有教师在本校获得诺贝尔奖或菲尔兹奖的大学，其前校长高锟获2009年诺贝尔物理学奖。
论文被引次数是国际上公认的反映学术研究影响力的主要指标。在汤森路透公司“高被引科学家”数据库统计公布的近三十年来在21个学科内全世界论文被引次数最高的6000余名科研人员中，香港科技大学、台湾大学、香港大学等港台高校都有多名高被引科学家，而大陆仅有中国科学技术大学等个别学校有1名。
虽然大陆绝大多数大学已要求新聘教师具有博士学位，但目前大陆高校教师队伍整体质量显然尚有待提高。排名榜中。有博士学位的教师比例占教师总数90%以上的10所大学，全部是港台大学，其他进入排名的港台大学的博士学位教师比例大多在80%以上，而大陆地区只有北京师范大学(微博)一所学校博士教师比例超过80%。
科研能力：港台高校师均表现领先
按近五年在《自然》和《科学》两本国际顶尖刊物上发表的论文数看，前三名分别是北京大学、中国科学技术大学和南京大学，全部是大陆高校，前十名(11所)中大陆大学有7所；但是，师均发表论文最多的是台湾的阳明大学，前十名中大陆高校只有3所。
年度发表SCIE和SSCI论文最多的是浙江大学，前十名中大陆高校有8所；但是师均发表此类论文的前十名大学中，大陆高校只有1所，其它9所全部是港台高校。
清华大学(北京)的国际专利数量位居两岸四地大学之首，但是师均数仅位列第六位。除清华大学(北京)外，没有其它大陆高校能够进入国际专利总量和师均数的前十名。清华大学(北京)以近25亿人民币的数额位列“年度科研经费”第一，前十名中大陆高校有6所；但师均科研经费中最高的是香港大学，接近200万人民币，前十名中大陆大学只有2所。
香港高校的办学经费显然最充裕。办学总经费和生均经费排名第一的都是香港大学，生均经费排名前十名的大学中香港的大学有7所，总经费排名前十的大学中香港的大学有4所。大陆地区的清华大学(北京)和台湾地区的台湾大学的办学总经费和生均办学经费排名也比较靠前。
